L’école Charles-Péguy est née de la volonté de deux femmes de la communauté Saint-François-Xavier : Madeleine Daniélou (1880-1956), fondatrice de la communauté Saint-François-Xavier, et Marie Comeau venue la rejoindre.

• Avril 1936 Ouverture d’un jardin d’enfants et d’un cours préparatoire au coeur des jardins ouvriers et maraîchers
• Septembre 1960 Le collège ouvre ses portes
• Septembre 1965 Ouverture du lycée.
  Très vite la place vient à manquer...
• 1975 Les cinq classes primaires et le gymnase s’installent dans un nouveau bâtiment rue du pré souverain
• 1986 Charles-Péguy fête ses 50 ans
• De 1989 à 1991 La bibliothèque s’agrandit et devient un vrai CDI, de nouveaux réfectoires sont aménagés
• 2004 C’est au tour des classes de sixième et cinquième d’intégrer un nouveau bâtiment
• 2006 Le festival Madeleine Daniélou rassemble tous les CMD, aux Docks, Porte de la Chapelle, proposant spectacles, tables-rondes, expositions, projections...

A la suite de Marie Comeau, les directrices qui ont animé Charles-Péguy
 Anne-Yvonne Baranger, sfx
 Françoise Blanchon, sfx
 Marguerite Salmon-Legagneur, sfx
 Nicole Duval, sfx
 Marie-Thérèse Abgrall, sfx
 Madame Catherine Langlois-Meurinne, école primaire
 Roselyne de Montrichard, sfx